O Curso de Mestrado em Arqueologia tem como objetivo proporcionar um complemento de formação à licenciatura. Assim, o atual plano de estudos procura aliar um complemento de formação no domínio teórico-metodológico, com uma continuada aprendizagem no campo dos métodos e técnicas de investigação e da sua aplicação prática, decisivos no apoio à pesquisa que sustenta a elaboração final dos trabalhos de Dissertação. Este modelo tem expressão num leque de unidades curriculares (UC): três Seminários de Investigação, com uma estrutura flexível, modular, capazes de responder com rapidez aos desenvolvimentos operados na investigação, assim como uma UC de Trabalhos Práticos, a mais creditada de todas, onde ocorre uma imersão real dos alunos nos contextos da investigação (de campo e de laboratório).